Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CDRT15Q96T59 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CDRT15Q96T59 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CDRT15Q96T59 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CDRT15Q96T59 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CDRT15Q96T59 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CDRT15Q96T59 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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