Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP53Q96M91 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms