Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms