Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms