Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms