Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms