Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms