Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE4Q8N205 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms