Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms