Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms