Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ATG4DQ86TL0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ATG4DQ86TL0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ATG4DQ86TL0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ATG4DQ86TL0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ATG4DQ86TL0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ATG4DQ86TL0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ATG4DQ86TL0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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