Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms