Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FBXO38Q6PIJ6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FBXO38Q6PIJ6 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FBXO38Q6PIJ6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FBXO38Q6PIJ6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FBXO38Q6PIJ6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FBXO38Q6PIJ6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FBXO38Q6PIJ6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FBXO38Q6PIJ6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FBXO38Q6PIJ6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FBXO38Q6PIJ6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FBXO38Q6PIJ6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FBXO38Q6PIJ6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FBXO38Q6PIJ6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
FBXO38Q6PIJ6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FBXO38Q6PIJ6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FBXO38Q6PIJ6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FBXO38Q6PIJ6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms