Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms