Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms