Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEF1DP3Q658K8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms