Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF17Q5VTA0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms