Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q5VSD8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms