Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms