Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms