Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms