Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms