Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms