Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms