Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms