Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHKAPQ2M3C7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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