Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MICAQ29983 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MICAQ29983 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MICAQ29983 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MICAQ29983 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MICAQ29983 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MICAQ29983 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms