Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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