Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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