Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SSX1Q16384 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SSX1Q16384 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SSX1Q16384 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SSX1Q16384 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SSX1Q16384 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SSX1Q16384 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SSX1Q16384 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SSX1Q16384 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SSX1Q16384 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SSX1Q16384 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SSX1Q16384 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SSX1Q16384 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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