Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
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