Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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ZNF56Q15929 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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ZNF56Q15929 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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ZNF56Q15929 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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ZNF56Q15929 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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ZNF56Q15929 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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ZNF56Q15929 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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