Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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VAMP3Q15836 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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VAMP3Q15836 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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