Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SIX1Q15475 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SIX1Q15475 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SIX1Q15475 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SIX1Q15475 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SIX1Q15475 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SIX1Q15475 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SIX1Q15475 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SIX1Q15475 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SIX1Q15475 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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SIX1Q15475 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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