Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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