Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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