Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCF4Q15080 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms