Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3GAP1Q15042 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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