Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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