Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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NBR1Q14596 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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NBR1Q14596 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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NBR1Q14596 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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NBR1Q14596 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NBR1Q14596 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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