Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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