Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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COL4A6Q14031 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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COL4A6Q14031 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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COL4A6Q14031 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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COL4A6Q14031 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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COL4A6Q14031 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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COL4A6Q14031 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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COL4A6Q14031 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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COL4A6Q14031 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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