Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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