Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms