Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms