Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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