Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms