Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTK7Q13308 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms