Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms