Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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